原始传奇里的神石不能通过普通合成界面，直接用多个低级神石合成高阶神石；神石系统主要分为镶嵌、回收、淬炼和商城兑换。玩家获得多余神石后，应前往庄园的神石商人处处理，先回收成神石精华，再根据需求进行淬炼或兑换。也就是说，神石存在回收材料—淬炼产物的间接合成路线，但不是常见的同类神石三合一、五合一玩法。
神石淬炼的具体操作是先进入庄园，找到神石商人，打开神石回收界面，将重复、属性不适合当前职业或暂时用不上的神石换成神石精华；随后切换到神石淬炼，准备1个天外神石、20个神石精华和20000个传奇币，材料齐全后即可淬炼出1个神秘之石。天外神石可通过神石商城或相关地图玩法获得，神石精华则主要来自神石回收和对应活动。材料数量不足时，淬炼按钮不会生效，不能用普通神石临时替代天外神石。
不同阶段的处理方式应按资源储备决定：刚开启神石功能时，优先保留能提升当前攻击、防御、准确或穿透属性的神石，不要为了凑精华全部回收；已经有稳定搭配后，再清理重复属性和暂时无法镶嵌的神石。若目标是快速补齐战力，应先查看神石商城能否直接兑换需要的类型，再决定是否投入20个精华进行淬炼；若目标是长期提升，则可以把低价值重复神石集中回收，避免背包占用。神石镶嵌后还要注意同类型神石最多生效3个，超过数量继续镶嵌也不会带来额外属性。
操作时最容易出现的误区，是把神石回收神石淬炼和普通装备合成混为一谈。回收只负责把闲置神石转成精华，不能直接生成更高等级神石；淬炼需要天外神石、20个精华和20000个传奇币，缺少任意一项都无法完成；商城兑换则消耗精华获得指定资源，不能把任意属性神石自由转换成想要的属性。确认神石属性、职业需求和镶嵌位置后，再处理重复材料，优先保证主装备的有效属性数量，才能避免回收后又花费资源重新补回。
